Protein–RNA interactions for Protein: P01641

Ig kappa chain V-V region MOPC 173B, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01641 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01641 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01641 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01641 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01641 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01641 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01641 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
P01641 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01641 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01641 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
P01641 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01641 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01641 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01641 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01641 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01641 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
P01641 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01641 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01641 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01641 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01641 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01641 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01641 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01641 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01641 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01641 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01641 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01641 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01641 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01641 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01641 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01641 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01641 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01641 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01641 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01641 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01641 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01641 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01641 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01641 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01641 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01641 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01641 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01641 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01641 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01641 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01641 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01641 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01641 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01641 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01641 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01641 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01641 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01641 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01641 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01641 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01641 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01641 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01641 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01641 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01641 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01641 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01641 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01641 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01641 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
P01641 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
P01641 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01641 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01641 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01641 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01641 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01641 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01641 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01641 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01641 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01641 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01641 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01641 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01641 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01641 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01641 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01641 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
P01641 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01641 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01641 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01641 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01641 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01641 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01641 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01641 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01641 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
P01641 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
P01641 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
P01641 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01641 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01641 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01641 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
P01641 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01641 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
P01641 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111 ms