Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ifnb1P01575 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifnb1P01575 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms