Protein–RNA interactions for Protein: O89110

Casp8, Caspase-8, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp8O89110 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Casp8O89110 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Casp8O89110 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Casp8O89110 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Casp8O89110 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Casp8O89110 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casp8O89110 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms