Protein–RNA interactions for Protein: O88967

Yme1l1, ATP-dependent zinc metalloprotease YME1L1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yme1l1O88967 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Yme1l1O88967 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Yme1l1O88967 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Yme1l1O88967 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Yme1l1O88967 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Yme1l1O88967 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Yme1l1O88967 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Yme1l1O88967 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Yme1l1O88967 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Yme1l1O88967 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Yme1l1O88967 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Yme1l1O88967 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Yme1l1O88967 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Yme1l1O88967 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Yme1l1O88967 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Yme1l1O88967 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Yme1l1O88967 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Yme1l1O88967 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Yme1l1O88967 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Yme1l1O88967 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Yme1l1O88967 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Yme1l1O88967 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Yme1l1O88967 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Yme1l1O88967 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Yme1l1O88967 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Yme1l1O88967 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Yme1l1O88967 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Yme1l1O88967 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Yme1l1O88967 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Yme1l1O88967 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Yme1l1O88967 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Yme1l1O88967 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Yme1l1O88967 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Yme1l1O88967 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Yme1l1O88967 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Yme1l1O88967 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Yme1l1O88967 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Yme1l1O88967 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Yme1l1O88967 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Yme1l1O88967 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Yme1l1O88967 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Yme1l1O88967 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Yme1l1O88967 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Yme1l1O88967 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Yme1l1O88967 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Yme1l1O88967 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Yme1l1O88967 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Yme1l1O88967 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Yme1l1O88967 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Yme1l1O88967 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Yme1l1O88967 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Yme1l1O88967 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Yme1l1O88967 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Yme1l1O88967 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Yme1l1O88967 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Yme1l1O88967 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Yme1l1O88967 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Yme1l1O88967 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Yme1l1O88967 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Yme1l1O88967 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Yme1l1O88967 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Yme1l1O88967 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Yme1l1O88967 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Yme1l1O88967 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Yme1l1O88967 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Yme1l1O88967 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Yme1l1O88967 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Yme1l1O88967 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Yme1l1O88967 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Yme1l1O88967 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Yme1l1O88967 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Yme1l1O88967 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Yme1l1O88967 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Yme1l1O88967 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Yme1l1O88967 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Yme1l1O88967 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Yme1l1O88967 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Yme1l1O88967 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Yme1l1O88967 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Yme1l1O88967 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Yme1l1O88967 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Yme1l1O88967 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Yme1l1O88967 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Yme1l1O88967 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Yme1l1O88967 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Yme1l1O88967 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Yme1l1O88967 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Yme1l1O88967 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Yme1l1O88967 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Yme1l1O88967 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Yme1l1O88967 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Yme1l1O88967 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Yme1l1O88967 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Yme1l1O88967 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Yme1l1O88967 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Yme1l1O88967 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Yme1l1O88967 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Yme1l1O88967 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Yme1l1O88967 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Yme1l1O88967 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms