Protein–RNA interactions for Protein: O55176

Pja1, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-1, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja1O55176 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pja1O55176 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pja1O55176 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pja1O55176 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pja1O55176 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pja1O55176 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pja1O55176 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pja1O55176 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pja1O55176 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pja1O55176 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pja1O55176 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pja1O55176 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pja1O55176 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pja1O55176 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pja1O55176 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pja1O55176 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pja1O55176 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pja1O55176 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pja1O55176 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pja1O55176 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pja1O55176 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pja1O55176 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pja1O55176 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pja1O55176 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pja1O55176 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pja1O55176 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pja1O55176 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pja1O55176 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pja1O55176 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pja1O55176 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pja1O55176 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pja1O55176 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pja1O55176 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pja1O55176 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pja1O55176 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pja1O55176 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pja1O55176 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pja1O55176 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pja1O55176 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pja1O55176 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pja1O55176 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pja1O55176 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pja1O55176 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pja1O55176 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pja1O55176 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pja1O55176 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pja1O55176 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pja1O55176 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pja1O55176 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pja1O55176 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pja1O55176 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pja1O55176 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pja1O55176 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pja1O55176 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pja1O55176 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pja1O55176 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pja1O55176 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pja1O55176 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pja1O55176 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pja1O55176 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pja1O55176 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pja1O55176 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pja1O55176 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pja1O55176 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pja1O55176 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pja1O55176 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pja1O55176 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pja1O55176 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pja1O55176 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pja1O55176 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pja1O55176 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pja1O55176 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pja1O55176 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pja1O55176 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pja1O55176 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pja1O55176 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pja1O55176 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pja1O55176 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pja1O55176 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pja1O55176 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pja1O55176 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pja1O55176 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pja1O55176 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pja1O55176 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pja1O55176 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pja1O55176 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pja1O55176 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pja1O55176 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pja1O55176 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pja1O55176 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pja1O55176 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pja1O55176 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pja1O55176 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pja1O55176 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pja1O55176 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pja1O55176 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pja1O55176 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pja1O55176 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pja1O55176 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pja1O55176 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms