Protein–RNA interactions for Protein: O55111

Dsg2, Desmoglein-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg2O55111 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dsg2O55111 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dsg2O55111 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dsg2O55111 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dsg2O55111 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dsg2O55111 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dsg2O55111 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dsg2O55111 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dsg2O55111 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dsg2O55111 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dsg2O55111 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dsg2O55111 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dsg2O55111 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dsg2O55111 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dsg2O55111 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dsg2O55111 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dsg2O55111 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dsg2O55111 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dsg2O55111 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dsg2O55111 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dsg2O55111 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dsg2O55111 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dsg2O55111 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Dsg2O55111 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dsg2O55111 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Dsg2O55111 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Dsg2O55111 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dsg2O55111 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dsg2O55111 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dsg2O55111 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dsg2O55111 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dsg2O55111 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dsg2O55111 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dsg2O55111 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dsg2O55111 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dsg2O55111 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dsg2O55111 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dsg2O55111 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dsg2O55111 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dsg2O55111 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dsg2O55111 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dsg2O55111 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Dsg2O55111 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dsg2O55111 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dsg2O55111 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dsg2O55111 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Dsg2O55111 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dsg2O55111 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dsg2O55111 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dsg2O55111 Gm18363-201ENSMUST00000221671 730 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Dsg2O55111 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dsg2O55111 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Dsg2O55111 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dsg2O55111 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dsg2O55111 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dsg2O55111 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Dsg2O55111 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dsg2O55111 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Dsg2O55111 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dsg2O55111 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dsg2O55111 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dsg2O55111 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dsg2O55111 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dsg2O55111 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dsg2O55111 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dsg2O55111 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dsg2O55111 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dsg2O55111 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dsg2O55111 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dsg2O55111 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dsg2O55111 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dsg2O55111 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dsg2O55111 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Dsg2O55111 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Dsg2O55111 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Dsg2O55111 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Dsg2O55111 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dsg2O55111 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Dsg2O55111 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Dsg2O55111 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Dsg2O55111 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Dsg2O55111 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Dsg2O55111 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dsg2O55111 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dsg2O55111 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dsg2O55111 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Dsg2O55111 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Dsg2O55111 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dsg2O55111 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dsg2O55111 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Dsg2O55111 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dsg2O55111 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dsg2O55111 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dsg2O55111 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Dsg2O55111 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dsg2O55111 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dsg2O55111 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Dsg2O55111 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dsg2O55111 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dsg2O55111 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms