Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SlkO54988 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SlkO54988 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SlkO54988 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SlkO54988 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SlkO54988 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SlkO54988 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SlkO54988 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SlkO54988 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SlkO54988 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SlkO54988 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SlkO54988 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SlkO54988 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SlkO54988 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SlkO54988 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SlkO54988 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SlkO54988 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SlkO54988 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SlkO54988 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SlkO54988 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SlkO54988 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SlkO54988 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SlkO54988 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SlkO54988 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SlkO54988 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SlkO54988 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SlkO54988 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SlkO54988 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SlkO54988 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SlkO54988 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SlkO54988 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SlkO54988 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SlkO54988 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SlkO54988 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SlkO54988 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SlkO54988 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SlkO54988 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SlkO54988 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SlkO54988 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
SlkO54988 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SlkO54988 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SlkO54988 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SlkO54988 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SlkO54988 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SlkO54988 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SlkO54988 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SlkO54988 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SlkO54988 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SlkO54988 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SlkO54988 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SlkO54988 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SlkO54988 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SlkO54988 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SlkO54988 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SlkO54988 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SlkO54988 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SlkO54988 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SlkO54988 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SlkO54988 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SlkO54988 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SlkO54988 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SlkO54988 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SlkO54988 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SlkO54988 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SlkO54988 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SlkO54988 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SlkO54988 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SlkO54988 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SlkO54988 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SlkO54988 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SlkO54988 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SlkO54988 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SlkO54988 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SlkO54988 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SlkO54988 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SlkO54988 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SlkO54988 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SlkO54988 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SlkO54988 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SlkO54988 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SlkO54988 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SlkO54988 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SlkO54988 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SlkO54988 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SlkO54988 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SlkO54988 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SlkO54988 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SlkO54988 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SlkO54988 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SlkO54988 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SlkO54988 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SlkO54988 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SlkO54988 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SlkO54988 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SlkO54988 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SlkO54988 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SlkO54988 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SlkO54988 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SlkO54988 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SlkO54988 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms