Protein–RNA interactions for Protein: O54967

Tnk2, Activated CDC42 kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnk2O54967 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnk2O54967 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms