Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CrxO54751 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
CrxO54751 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CrxO54751 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CrxO54751 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CrxO54751 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CrxO54751 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CrxO54751 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
CrxO54751 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CrxO54751 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CrxO54751 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CrxO54751 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CrxO54751 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CrxO54751 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CrxO54751 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CrxO54751 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CrxO54751 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CrxO54751 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CrxO54751 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CrxO54751 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CrxO54751 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CrxO54751 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CrxO54751 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CrxO54751 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CrxO54751 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
CrxO54751 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CrxO54751 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CrxO54751 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CrxO54751 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CrxO54751 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CrxO54751 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CrxO54751 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CrxO54751 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CrxO54751 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CrxO54751 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CrxO54751 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CrxO54751 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CrxO54751 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CrxO54751 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CrxO54751 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CrxO54751 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CrxO54751 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CrxO54751 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CrxO54751 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CrxO54751 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CrxO54751 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CrxO54751 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CrxO54751 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CrxO54751 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CrxO54751 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CrxO54751 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CrxO54751 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CrxO54751 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CrxO54751 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CrxO54751 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CrxO54751 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CrxO54751 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CrxO54751 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CrxO54751 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CrxO54751 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CrxO54751 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CrxO54751 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CrxO54751 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CrxO54751 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CrxO54751 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CrxO54751 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CrxO54751 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CrxO54751 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CrxO54751 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CrxO54751 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CrxO54751 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CrxO54751 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CrxO54751 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
CrxO54751 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CrxO54751 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CrxO54751 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
CrxO54751 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CrxO54751 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CrxO54751 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CrxO54751 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CrxO54751 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
CrxO54751 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CrxO54751 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CrxO54751 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CrxO54751 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CrxO54751 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
CrxO54751 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
CrxO54751 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CrxO54751 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CrxO54751 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CrxO54751 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CrxO54751 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CrxO54751 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
CrxO54751 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CrxO54751 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
CrxO54751 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CrxO54751 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CrxO54751 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CrxO54751 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CrxO54751 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms