Protein–RNA interactions for Protein: O35903

Ccl25, C-C motif chemokine 25, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl25O35903 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl25O35903 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl25O35903 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl25O35903 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl25O35903 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl25O35903 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl25O35903 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl25O35903 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl25O35903 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl25O35903 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl25O35903 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl25O35903 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl25O35903 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl25O35903 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl25O35903 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl25O35903 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl25O35903 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl25O35903 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl25O35903 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl25O35903 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl25O35903 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl25O35903 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl25O35903 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl25O35903 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl25O35903 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl25O35903 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl25O35903 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl25O35903 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl25O35903 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl25O35903 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl25O35903 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl25O35903 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl25O35903 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl25O35903 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl25O35903 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl25O35903 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl25O35903 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl25O35903 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl25O35903 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl25O35903 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl25O35903 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl25O35903 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl25O35903 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl25O35903 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl25O35903 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl25O35903 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl25O35903 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl25O35903 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl25O35903 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl25O35903 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl25O35903 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl25O35903 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.71
Ccl25O35903 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Ccl25O35903 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl25O35903 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl25O35903 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl25O35903 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl25O35903 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl25O35903 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl25O35903 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl25O35903 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl25O35903 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl25O35903 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl25O35903 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl25O35903 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl25O35903 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl25O35903 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl25O35903 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl25O35903 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl25O35903 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl25O35903 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl25O35903 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl25O35903 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl25O35903 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl25O35903 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl25O35903 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl25O35903 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl25O35903 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl25O35903 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl25O35903 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl25O35903 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl25O35903 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl25O35903 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl25O35903 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl25O35903 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl25O35903 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl25O35903 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl25O35903 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl25O35903 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl25O35903 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl25O35903 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl25O35903 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl25O35903 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl25O35903 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl25O35903 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl25O35903 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl25O35903 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl25O35903 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl25O35903 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl25O35903 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms