Protein–RNA interactions for Protein: O35857

Timm44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, mousemouse

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Length 452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm44O35857 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Timm44O35857 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Timm44O35857 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Timm44O35857 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Timm44O35857 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Timm44O35857 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Timm44O35857 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Timm44O35857 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Timm44O35857 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Timm44O35857 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Timm44O35857 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Timm44O35857 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Timm44O35857 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Timm44O35857 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
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Timm44O35857 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Timm44O35857 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Timm44O35857 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Timm44O35857 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Timm44O35857 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Timm44O35857 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Timm44O35857 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Timm44O35857 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Timm44O35857 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Timm44O35857 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Timm44O35857 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Timm44O35857 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Timm44O35857 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Timm44O35857 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Timm44O35857 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Timm44O35857 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Timm44O35857 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Timm44O35857 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Timm44O35857 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Timm44O35857 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Timm44O35857 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Timm44O35857 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Timm44O35857 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Timm44O35857 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Timm44O35857 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Timm44O35857 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Timm44O35857 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Timm44O35857 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Timm44O35857 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Timm44O35857 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Timm44O35857 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Timm44O35857 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Timm44O35857 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Timm44O35857 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Timm44O35857 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Timm44O35857 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Timm44O35857 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Timm44O35857 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Timm44O35857 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Timm44O35857 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Timm44O35857 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Timm44O35857 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Timm44O35857 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Timm44O35857 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Timm44O35857 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Timm44O35857 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Timm44O35857 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Timm44O35857 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Timm44O35857 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Timm44O35857 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Timm44O35857 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms