Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
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Opn1mwO35599 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Opn1mwO35599 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Opn1mwO35599 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Opn1mwO35599 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
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Opn1mwO35599 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Opn1mwO35599 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Opn1mwO35599 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Opn1mwO35599 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Opn1mwO35599 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Opn1mwO35599 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Opn1mwO35599 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Opn1mwO35599 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Opn1mwO35599 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Opn1mwO35599 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Opn1mwO35599 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Opn1mwO35599 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Opn1mwO35599 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Opn1mwO35599 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Opn1mwO35599 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Opn1mwO35599 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Opn1mwO35599 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Opn1mwO35599 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Opn1mwO35599 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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