Protein–RNA interactions for Protein: O35595

Ptch2, Protein patched homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptch2O35595 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptch2O35595 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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