Protein–RNA interactions for Protein: O35309

Nmi, N-myc-interactor, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmiO35309 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NmiO35309 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NmiO35309 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NmiO35309 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NmiO35309 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NmiO35309 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NmiO35309 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
NmiO35309 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NmiO35309 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NmiO35309 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NmiO35309 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NmiO35309 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NmiO35309 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NmiO35309 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NmiO35309 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NmiO35309 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NmiO35309 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NmiO35309 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NmiO35309 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NmiO35309 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NmiO35309 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NmiO35309 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NmiO35309 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NmiO35309 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NmiO35309 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NmiO35309 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NmiO35309 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NmiO35309 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NmiO35309 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NmiO35309 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NmiO35309 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NmiO35309 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
NmiO35309 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
NmiO35309 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NmiO35309 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NmiO35309 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NmiO35309 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NmiO35309 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NmiO35309 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NmiO35309 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NmiO35309 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NmiO35309 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NmiO35309 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NmiO35309 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NmiO35309 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NmiO35309 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NmiO35309 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NmiO35309 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NmiO35309 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NmiO35309 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NmiO35309 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NmiO35309 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NmiO35309 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NmiO35309 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NmiO35309 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
NmiO35309 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
NmiO35309 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
NmiO35309 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NmiO35309 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NmiO35309 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NmiO35309 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NmiO35309 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NmiO35309 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NmiO35309 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NmiO35309 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NmiO35309 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NmiO35309 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NmiO35309 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NmiO35309 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NmiO35309 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
NmiO35309 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NmiO35309 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NmiO35309 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NmiO35309 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NmiO35309 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
NmiO35309 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NmiO35309 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NmiO35309 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NmiO35309 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NmiO35309 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NmiO35309 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NmiO35309 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
NmiO35309 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
NmiO35309 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NmiO35309 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NmiO35309 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NmiO35309 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NmiO35309 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NmiO35309 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NmiO35309 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NmiO35309 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NmiO35309 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NmiO35309 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NmiO35309 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NmiO35309 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NmiO35309 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NmiO35309 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NmiO35309 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
NmiO35309 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NmiO35309 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms