Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Bhlhe40O35185 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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