Protein–RNA interactions for Protein: O35111

Kcnk3, Potassium channel subfamily K member 3, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnk3O35111 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Kcnk3O35111 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Kcnk3O35111 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Kcnk3O35111 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Kcnk3O35111 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Kcnk3O35111 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Kcnk3O35111 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Kcnk3O35111 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Kcnk3O35111 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Kcnk3O35111 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Kcnk3O35111 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Kcnk3O35111 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Kcnk3O35111 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Kcnk3O35111 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Kcnk3O35111 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Kcnk3O35111 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Kcnk3O35111 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Kcnk3O35111 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Kcnk3O35111 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Kcnk3O35111 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Kcnk3O35111 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Kcnk3O35111 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Kcnk3O35111 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Kcnk3O35111 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Kcnk3O35111 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
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Kcnk3O35111 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Kcnk3O35111 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Kcnk3O35111 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Kcnk3O35111 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Kcnk3O35111 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kcnk3O35111 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Kcnk3O35111 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kcnk3O35111 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kcnk3O35111 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kcnk3O35111 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kcnk3O35111 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kcnk3O35111 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kcnk3O35111 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kcnk3O35111 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kcnk3O35111 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Kcnk3O35111 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Kcnk3O35111 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Kcnk3O35111 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Kcnk3O35111 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Kcnk3O35111 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Kcnk3O35111 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kcnk3O35111 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kcnk3O35111 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kcnk3O35111 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kcnk3O35111 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kcnk3O35111 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Kcnk3O35111 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Kcnk3O35111 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Kcnk3O35111 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Kcnk3O35111 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Kcnk3O35111 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Kcnk3O35111 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Kcnk3O35111 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Kcnk3O35111 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Kcnk3O35111 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Kcnk3O35111 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Kcnk3O35111 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Kcnk3O35111 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Kcnk3O35111 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Kcnk3O35111 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Kcnk3O35111 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Kcnk3O35111 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Kcnk3O35111 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Kcnk3O35111 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Kcnk3O35111 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Kcnk3O35111 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Kcnk3O35111 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Kcnk3O35111 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Kcnk3O35111 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms