Protein–RNA interactions for Protein: O08919

Numbl, Numb-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NumblO08919 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NumblO08919 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NumblO08919 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NumblO08919 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NumblO08919 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NumblO08919 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NumblO08919 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NumblO08919 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NumblO08919 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NumblO08919 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NumblO08919 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NumblO08919 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NumblO08919 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NumblO08919 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NumblO08919 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NumblO08919 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NumblO08919 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NumblO08919 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NumblO08919 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NumblO08919 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NumblO08919 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NumblO08919 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NumblO08919 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NumblO08919 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NumblO08919 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NumblO08919 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NumblO08919 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NumblO08919 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NumblO08919 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NumblO08919 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NumblO08919 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NumblO08919 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NumblO08919 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NumblO08919 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NumblO08919 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NumblO08919 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NumblO08919 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NumblO08919 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NumblO08919 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NumblO08919 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NumblO08919 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NumblO08919 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NumblO08919 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NumblO08919 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NumblO08919 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NumblO08919 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NumblO08919 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NumblO08919 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NumblO08919 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NumblO08919 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NumblO08919 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NumblO08919 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NumblO08919 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NumblO08919 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NumblO08919 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NumblO08919 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NumblO08919 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NumblO08919 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NumblO08919 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NumblO08919 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NumblO08919 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NumblO08919 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NumblO08919 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NumblO08919 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NumblO08919 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NumblO08919 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NumblO08919 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NumblO08919 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NumblO08919 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NumblO08919 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NumblO08919 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NumblO08919 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NumblO08919 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NumblO08919 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NumblO08919 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NumblO08919 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NumblO08919 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NumblO08919 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NumblO08919 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NumblO08919 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NumblO08919 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NumblO08919 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NumblO08919 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NumblO08919 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NumblO08919 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NumblO08919 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NumblO08919 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NumblO08919 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NumblO08919 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NumblO08919 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NumblO08919 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NumblO08919 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NumblO08919 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NumblO08919 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NumblO08919 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NumblO08919 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NumblO08919 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NumblO08919 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NumblO08919 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NumblO08919 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms