Protein–RNA interactions for Protein: O08665

Sema3a, Semaphorin-3A, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3aO08665 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema3aO08665 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms