Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20939L7N243 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20939L7N243 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms