Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS7

Gm11236, Predicted gene 11236, mousemouse

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Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11236J3QMS7 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Gm11236J3QMS7 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Gm11236J3QMS7 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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