Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ9

Gm20873, Predicted gene, 20873, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20873J3QMQ9 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20873J3QMQ9 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20873J3QMQ9 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20873J3QMQ9 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20873J3QMQ9 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20873J3QMQ9 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20873J3QMQ9 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20873J3QMQ9 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20873J3QMQ9 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20873J3QMQ9 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20873J3QMQ9 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20873J3QMQ9 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20873J3QMQ9 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20873J3QMQ9 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20873J3QMQ9 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20873J3QMQ9 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20873J3QMQ9 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20873J3QMQ9 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20873J3QMQ9 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Gm20873J3QMQ9 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20873J3QMQ9 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20873J3QMQ9 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20873J3QMQ9 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20873J3QMQ9 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20873J3QMQ9 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20873J3QMQ9 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20873J3QMQ9 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Gm20873J3QMQ9 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20873J3QMQ9 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Gm20873J3QMQ9 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Gm20873J3QMQ9 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20873J3QMQ9 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20873J3QMQ9 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20873J3QMQ9 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20873J3QMQ9 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20873J3QMQ9 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20873J3QMQ9 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20873J3QMQ9 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Gm20873J3QMQ9 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20873J3QMQ9 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Gm20873J3QMQ9 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Gm20873J3QMQ9 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Gm20873J3QMQ9 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20873J3QMQ9 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20873J3QMQ9 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20873J3QMQ9 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20873J3QMQ9 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20873J3QMQ9 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20873J3QMQ9 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20873J3QMQ9 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20873J3QMQ9 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20873J3QMQ9 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20873J3QMQ9 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20873J3QMQ9 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20873J3QMQ9 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20873J3QMQ9 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20873J3QMQ9 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20873J3QMQ9 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20873J3QMQ9 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20873J3QMQ9 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm20873J3QMQ9 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm20873J3QMQ9 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
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