Protein–RNA interactions for Protein: H3BIW7

Gm29394, Predicted gene 29394, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29394H3BIW7 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Gm29394H3BIW7 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Gm29394H3BIW7 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Gm29394H3BIW7 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Gm29394H3BIW7 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Gm29394H3BIW7 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Gm29394H3BIW7 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm29394H3BIW7 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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