Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X0

Cldn20, Claudin, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn20G5E8X0 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn20G5E8X0 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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