Protein–RNA interactions for Protein: G5E8V9

Arfip1, ADP-ribosylation factor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfip1G5E8V9 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arfip1G5E8V9 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arfip1G5E8V9 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms