Protein–RNA interactions for Protein: G3X996

Zfp846, RIKEN cDNA 2210010B09, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp846G3X996 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp846G3X996 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp846G3X996 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp846G3X996 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp846G3X996 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp846G3X996 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp846G3X996 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp846G3X996 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp846G3X996 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp846G3X996 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp846G3X996 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp846G3X996 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp846G3X996 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp846G3X996 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp846G3X996 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp846G3X996 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp846G3X996 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp846G3X996 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp846G3X996 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp846G3X996 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp846G3X996 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp846G3X996 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp846G3X996 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp846G3X996 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp846G3X996 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp846G3X996 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp846G3X996 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp846G3X996 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp846G3X996 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp846G3X996 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp846G3X996 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp846G3X996 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp846G3X996 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp846G3X996 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp846G3X996 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp846G3X996 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp846G3X996 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp846G3X996 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp846G3X996 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp846G3X996 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp846G3X996 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp846G3X996 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp846G3X996 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp846G3X996 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp846G3X996 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp846G3X996 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp846G3X996 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp846G3X996 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp846G3X996 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp846G3X996 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp846G3X996 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp846G3X996 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp846G3X996 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp846G3X996 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp846G3X996 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp846G3X996 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfp846G3X996 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfp846G3X996 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfp846G3X996 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfp846G3X996 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfp846G3X996 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfp846G3X996 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfp846G3X996 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfp846G3X996 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfp846G3X996 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms