Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Y1

Trim55, MCG19772, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim55G3X8Y1 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim55G3X8Y1 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms