Protein–RNA interactions for Protein: G3UVU6

Gm20517, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 20, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20517G3UVU6 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm20517G3UVU6 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm20517G3UVU6 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm20517G3UVU6 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm20517G3UVU6 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm20517G3UVU6 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm20517G3UVU6 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm20517G3UVU6 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm20517G3UVU6 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm20517G3UVU6 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20517G3UVU6 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20517G3UVU6 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20517G3UVU6 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20517G3UVU6 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20517G3UVU6 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20517G3UVU6 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20517G3UVU6 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20517G3UVU6 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20517G3UVU6 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms