Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ3

Usp32, Ubiquitin-specific peptidase 32, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp32F8VPZ3 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp32F8VPZ3 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp32F8VPZ3 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp32F8VPZ3 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp32F8VPZ3 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp32F8VPZ3 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp32F8VPZ3 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp32F8VPZ3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp32F8VPZ3 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp32F8VPZ3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp32F8VPZ3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp32F8VPZ3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp32F8VPZ3 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp32F8VPZ3 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp32F8VPZ3 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp32F8VPZ3 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp32F8VPZ3 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp32F8VPZ3 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp32F8VPZ3 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp32F8VPZ3 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp32F8VPZ3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp32F8VPZ3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp32F8VPZ3 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp32F8VPZ3 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp32F8VPZ3 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp32F8VPZ3 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp32F8VPZ3 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp32F8VPZ3 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp32F8VPZ3 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp32F8VPZ3 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp32F8VPZ3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp32F8VPZ3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp32F8VPZ3 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp32F8VPZ3 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp32F8VPZ3 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp32F8VPZ3 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp32F8VPZ3 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp32F8VPZ3 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp32F8VPZ3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp32F8VPZ3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp32F8VPZ3 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp32F8VPZ3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp32F8VPZ3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp32F8VPZ3 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp32F8VPZ3 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp32F8VPZ3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Usp32F8VPZ3 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Usp32F8VPZ3 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Usp32F8VPZ3 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Usp32F8VPZ3 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Usp32F8VPZ3 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Usp32F8VPZ3 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Usp32F8VPZ3 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp32F8VPZ3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp32F8VPZ3 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp32F8VPZ3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp32F8VPZ3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp32F8VPZ3 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp32F8VPZ3 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp32F8VPZ3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp32F8VPZ3 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp32F8VPZ3 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp32F8VPZ3 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp32F8VPZ3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp32F8VPZ3 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp32F8VPZ3 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp32F8VPZ3 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp32F8VPZ3 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp32F8VPZ3 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp32F8VPZ3 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp32F8VPZ3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp32F8VPZ3 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp32F8VPZ3 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp32F8VPZ3 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp32F8VPZ3 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp32F8VPZ3 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp32F8VPZ3 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp32F8VPZ3 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp32F8VPZ3 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp32F8VPZ3 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp32F8VPZ3 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp32F8VPZ3 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp32F8VPZ3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp32F8VPZ3 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp32F8VPZ3 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp32F8VPZ3 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp32F8VPZ3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp32F8VPZ3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp32F8VPZ3 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp32F8VPZ3 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp32F8VPZ3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp32F8VPZ3 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp32F8VPZ3 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp32F8VPZ3 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp32F8VPZ3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp32F8VPZ3 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp32F8VPZ3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp32F8VPZ3 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp32F8VPZ3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp32F8VPZ3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms