Protein–RNA interactions for Protein: F8VPX6

Speer4a, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4aF8VPX6 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Speer4aF8VPX6 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Speer4aF8VPX6 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Speer4aF8VPX6 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Speer4aF8VPX6 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Speer4aF8VPX6 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Speer4aF8VPX6 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Speer4aF8VPX6 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Speer4aF8VPX6 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Speer4aF8VPX6 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Speer4aF8VPX6 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Speer4aF8VPX6 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Speer4aF8VPX6 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Speer4aF8VPX6 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Speer4aF8VPX6 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Speer4aF8VPX6 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Speer4aF8VPX6 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Speer4aF8VPX6 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Speer4aF8VPX6 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Speer4aF8VPX6 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Speer4aF8VPX6 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Speer4aF8VPX6 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Speer4aF8VPX6 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Speer4aF8VPX6 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Speer4aF8VPX6 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Speer4aF8VPX6 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Speer4aF8VPX6 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Speer4aF8VPX6 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Speer4aF8VPX6 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Speer4aF8VPX6 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Speer4aF8VPX6 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Speer4aF8VPX6 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Speer4aF8VPX6 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Speer4aF8VPX6 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Speer4aF8VPX6 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Speer4aF8VPX6 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Speer4aF8VPX6 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Speer4aF8VPX6 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Speer4aF8VPX6 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Speer4aF8VPX6 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Speer4aF8VPX6 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Speer4aF8VPX6 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Speer4aF8VPX6 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Speer4aF8VPX6 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Speer4aF8VPX6 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Speer4aF8VPX6 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Speer4aF8VPX6 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Speer4aF8VPX6 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Speer4aF8VPX6 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Speer4aF8VPX6 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Speer4aF8VPX6 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Speer4aF8VPX6 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Speer4aF8VPX6 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Speer4aF8VPX6 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Speer4aF8VPX6 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Speer4aF8VPX6 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Speer4aF8VPX6 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Speer4aF8VPX6 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Speer4aF8VPX6 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Speer4aF8VPX6 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Speer4aF8VPX6 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Speer4aF8VPX6 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Speer4aF8VPX6 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Speer4aF8VPX6 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Speer4aF8VPX6 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Speer4aF8VPX6 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Speer4aF8VPX6 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Speer4aF8VPX6 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Speer4aF8VPX6 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Speer4aF8VPX6 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Speer4aF8VPX6 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Speer4aF8VPX6 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Speer4aF8VPX6 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Speer4aF8VPX6 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Speer4aF8VPX6 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Speer4aF8VPX6 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Speer4aF8VPX6 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Speer4aF8VPX6 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Speer4aF8VPX6 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Speer4aF8VPX6 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Speer4aF8VPX6 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Speer4aF8VPX6 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Speer4aF8VPX6 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Speer4aF8VPX6 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Speer4aF8VPX6 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Speer4aF8VPX6 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Speer4aF8VPX6 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Speer4aF8VPX6 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Speer4aF8VPX6 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Speer4aF8VPX6 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Speer4aF8VPX6 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Speer4aF8VPX6 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Speer4aF8VPX6 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Speer4aF8VPX6 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Speer4aF8VPX6 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Speer4aF8VPX6 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Speer4aF8VPX6 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Speer4aF8VPX6 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Speer4aF8VPX6 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Speer4aF8VPX6 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms