Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Usp9yF8VPU6 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Usp9yF8VPU6 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Usp9yF8VPU6 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Usp9yF8VPU6 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Usp9yF8VPU6 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Usp9yF8VPU6 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
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Usp9yF8VPU6 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Usp9yF8VPU6 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Usp9yF8VPU6 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Usp9yF8VPU6 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Usp9yF8VPU6 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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