Protein–RNA interactions for Protein: F6XS56

Gm8444, Predicted gene 8444, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8444F6XS56 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm8444F6XS56 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm8444F6XS56 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm8444F6XS56 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm8444F6XS56 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8444F6XS56 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8444F6XS56 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8444F6XS56 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8444F6XS56 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8444F6XS56 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8444F6XS56 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8444F6XS56 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8444F6XS56 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8444F6XS56 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8444F6XS56 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8444F6XS56 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8444F6XS56 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8444F6XS56 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8444F6XS56 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8444F6XS56 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8444F6XS56 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8444F6XS56 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8444F6XS56 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8444F6XS56 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8444F6XS56 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8444F6XS56 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8444F6XS56 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8444F6XS56 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8444F6XS56 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8444F6XS56 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8444F6XS56 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8444F6XS56 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8444F6XS56 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8444F6XS56 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8444F6XS56 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8444F6XS56 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8444F6XS56 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8444F6XS56 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8444F6XS56 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8444F6XS56 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8444F6XS56 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8444F6XS56 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8444F6XS56 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8444F6XS56 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8444F6XS56 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8444F6XS56 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8444F6XS56 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8444F6XS56 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8444F6XS56 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8444F6XS56 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8444F6XS56 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm8444F6XS56 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm8444F6XS56 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8444F6XS56 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8444F6XS56 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8444F6XS56 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm8444F6XS56 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8444F6XS56 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8444F6XS56 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8444F6XS56 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8444F6XS56 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8444F6XS56 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8444F6XS56 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8444F6XS56 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8444F6XS56 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm8444F6XS56 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm8444F6XS56 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm8444F6XS56 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm8444F6XS56 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm8444F6XS56 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm8444F6XS56 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm8444F6XS56 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm8444F6XS56 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm8444F6XS56 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm8444F6XS56 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm8444F6XS56 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm8444F6XS56 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm8444F6XS56 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm8444F6XS56 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm8444F6XS56 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gm8444F6XS56 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm8444F6XS56 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm8444F6XS56 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm8444F6XS56 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm8444F6XS56 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm8444F6XS56 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm8444F6XS56 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm8444F6XS56 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm8444F6XS56 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm8444F6XS56 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm8444F6XS56 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm8444F6XS56 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm8444F6XS56 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm8444F6XS56 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm8444F6XS56 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm8444F6XS56 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm8444F6XS56 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm8444F6XS56 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm8444F6XS56 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm8444F6XS56 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms