Protein–RNA interactions for Protein: F6VRJ8

Gm8247, Predicted gene 8247 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8247F6VRJ8 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Gm8247F6VRJ8 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
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Gm8247F6VRJ8 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Gm8247F6VRJ8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Gm8247F6VRJ8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Gm8247F6VRJ8 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Gm8247F6VRJ8 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Gm8247F6VRJ8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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