Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm28305F6U473 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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