Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9K5

Trdn, Triadin, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdnE9Q9K5 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TrdnE9Q9K5 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TrdnE9Q9K5 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TrdnE9Q9K5 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TrdnE9Q9K5 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TrdnE9Q9K5 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TrdnE9Q9K5 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TrdnE9Q9K5 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TrdnE9Q9K5 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TrdnE9Q9K5 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TrdnE9Q9K5 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TrdnE9Q9K5 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TrdnE9Q9K5 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TrdnE9Q9K5 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TrdnE9Q9K5 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TrdnE9Q9K5 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TrdnE9Q9K5 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TrdnE9Q9K5 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TrdnE9Q9K5 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TrdnE9Q9K5 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TrdnE9Q9K5 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TrdnE9Q9K5 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TrdnE9Q9K5 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TrdnE9Q9K5 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms