Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5Z5

Fancf, Fanconi anemia group F protein, mousemouse

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FancfE9Q5Z5 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
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FancfE9Q5Z5 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FancfE9Q5Z5 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FancfE9Q5Z5 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FancfE9Q5Z5 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FancfE9Q5Z5 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FancfE9Q5Z5 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FancfE9Q5Z5 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FancfE9Q5Z5 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FancfE9Q5Z5 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FancfE9Q5Z5 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FancfE9Q5Z5 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FancfE9Q5Z5 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FancfE9Q5Z5 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FancfE9Q5Z5 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FancfE9Q5Z5 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FancfE9Q5Z5 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FancfE9Q5Z5 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FancfE9Q5Z5 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FancfE9Q5Z5 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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FancfE9Q5Z5 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FancfE9Q5Z5 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FancfE9Q5Z5 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FancfE9Q5Z5 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FancfE9Q5Z5 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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FancfE9Q5Z5 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FancfE9Q5Z5 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FancfE9Q5Z5 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FancfE9Q5Z5 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FancfE9Q5Z5 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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FancfE9Q5Z5 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FancfE9Q5Z5 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FancfE9Q5Z5 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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FancfE9Q5Z5 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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FancfE9Q5Z5 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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FancfE9Q5Z5 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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FancfE9Q5Z5 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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FancfE9Q5Z5 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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FancfE9Q5Z5 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FancfE9Q5Z5 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FancfE9Q5Z5 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FancfE9Q5Z5 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FancfE9Q5Z5 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FancfE9Q5Z5 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
FancfE9Q5Z5 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
FancfE9Q5Z5 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FancfE9Q5Z5 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FancfE9Q5Z5 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FancfE9Q5Z5 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FancfE9Q5Z5 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FancfE9Q5Z5 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FancfE9Q5Z5 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FancfE9Q5Z5 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FancfE9Q5Z5 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms