Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5E2

BC005561, cDNA sequence BC005561, mousemouse

Predictions only

Length 1,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC005561E9Q5E2 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BC005561E9Q5E2 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BC005561E9Q5E2 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BC005561E9Q5E2 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
BC005561E9Q5E2 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BC005561E9Q5E2 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BC005561E9Q5E2 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BC005561E9Q5E2 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BC005561E9Q5E2 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BC005561E9Q5E2 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
BC005561E9Q5E2 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BC005561E9Q5E2 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
BC005561E9Q5E2 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BC005561E9Q5E2 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BC005561E9Q5E2 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BC005561E9Q5E2 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BC005561E9Q5E2 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BC005561E9Q5E2 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BC005561E9Q5E2 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
BC005561E9Q5E2 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BC005561E9Q5E2 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BC005561E9Q5E2 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
BC005561E9Q5E2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BC005561E9Q5E2 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BC005561E9Q5E2 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BC005561E9Q5E2 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BC005561E9Q5E2 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BC005561E9Q5E2 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BC005561E9Q5E2 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BC005561E9Q5E2 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BC005561E9Q5E2 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BC005561E9Q5E2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BC005561E9Q5E2 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BC005561E9Q5E2 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BC005561E9Q5E2 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BC005561E9Q5E2 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BC005561E9Q5E2 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
BC005561E9Q5E2 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BC005561E9Q5E2 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BC005561E9Q5E2 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BC005561E9Q5E2 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BC005561E9Q5E2 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BC005561E9Q5E2 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BC005561E9Q5E2 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BC005561E9Q5E2 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BC005561E9Q5E2 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BC005561E9Q5E2 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BC005561E9Q5E2 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BC005561E9Q5E2 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BC005561E9Q5E2 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BC005561E9Q5E2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BC005561E9Q5E2 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BC005561E9Q5E2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BC005561E9Q5E2 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BC005561E9Q5E2 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BC005561E9Q5E2 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BC005561E9Q5E2 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BC005561E9Q5E2 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BC005561E9Q5E2 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BC005561E9Q5E2 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BC005561E9Q5E2 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BC005561E9Q5E2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BC005561E9Q5E2 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BC005561E9Q5E2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BC005561E9Q5E2 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BC005561E9Q5E2 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BC005561E9Q5E2 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BC005561E9Q5E2 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BC005561E9Q5E2 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
BC005561E9Q5E2 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BC005561E9Q5E2 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BC005561E9Q5E2 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BC005561E9Q5E2 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BC005561E9Q5E2 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BC005561E9Q5E2 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BC005561E9Q5E2 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BC005561E9Q5E2 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BC005561E9Q5E2 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BC005561E9Q5E2 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BC005561E9Q5E2 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BC005561E9Q5E2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BC005561E9Q5E2 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
BC005561E9Q5E2 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BC005561E9Q5E2 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BC005561E9Q5E2 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BC005561E9Q5E2 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BC005561E9Q5E2 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BC005561E9Q5E2 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BC005561E9Q5E2 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BC005561E9Q5E2 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BC005561E9Q5E2 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BC005561E9Q5E2 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BC005561E9Q5E2 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BC005561E9Q5E2 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
BC005561E9Q5E2 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BC005561E9Q5E2 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BC005561E9Q5E2 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BC005561E9Q5E2 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BC005561E9Q5E2 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BC005561E9Q5E2 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms