Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC9.2□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC9.2□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC9.18□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC9.18□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
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