Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2E9

Krtap11-1, Keratin-associated protein 11-1, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap11-1E9Q2E9 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms