Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

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Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
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Pdzd2E9Q1M1 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
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Pdzd2E9Q1M1 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
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Pdzd2E9Q1M1 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Pdzd2E9Q1M1 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Pdzd2E9Q1M1 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Pdzd2E9Q1M1 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Pdzd2E9Q1M1 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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