Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0B4

Cdr1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr1E9Q0B4 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdr1E9Q0B4 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdr1E9Q0B4 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cdr1E9Q0B4 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdr1E9Q0B4 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdr1E9Q0B4 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cdr1E9Q0B4 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdr1E9Q0B4 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cdr1E9Q0B4 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdr1E9Q0B4 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdr1E9Q0B4 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdr1E9Q0B4 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdr1E9Q0B4 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdr1E9Q0B4 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdr1E9Q0B4 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdr1E9Q0B4 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cdr1E9Q0B4 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdr1E9Q0B4 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdr1E9Q0B4 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdr1E9Q0B4 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdr1E9Q0B4 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdr1E9Q0B4 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdr1E9Q0B4 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdr1E9Q0B4 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdr1E9Q0B4 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdr1E9Q0B4 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdr1E9Q0B4 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdr1E9Q0B4 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdr1E9Q0B4 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdr1E9Q0B4 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdr1E9Q0B4 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdr1E9Q0B4 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdr1E9Q0B4 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdr1E9Q0B4 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdr1E9Q0B4 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdr1E9Q0B4 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdr1E9Q0B4 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdr1E9Q0B4 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdr1E9Q0B4 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdr1E9Q0B4 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdr1E9Q0B4 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdr1E9Q0B4 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdr1E9Q0B4 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdr1E9Q0B4 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdr1E9Q0B4 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdr1E9Q0B4 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdr1E9Q0B4 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms