Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rsph10bE9PYQ0 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rsph10bE9PYQ0 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rsph10bE9PYQ0 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rsph10bE9PYQ0 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rsph10bE9PYQ0 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rsph10bE9PYQ0 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rsph10bE9PYQ0 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rsph10bE9PYQ0 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rsph10bE9PYQ0 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms