Protein–RNA interactions for Protein: E9PW72

Gm3002, Predicted gene 3002, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3002E9PW72 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3002E9PW72 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms