Protein–RNA interactions for Protein: E9PVD1

Ccdc62, Coiled-coil domain-containing protein 62, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc62E9PVD1 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc62E9PVD1 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc62E9PVD1 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc62E9PVD1 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc62E9PVD1 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc62E9PVD1 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc62E9PVD1 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc62E9PVD1 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc62E9PVD1 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc62E9PVD1 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc62E9PVD1 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc62E9PVD1 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc62E9PVD1 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc62E9PVD1 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc62E9PVD1 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc62E9PVD1 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc62E9PVD1 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc62E9PVD1 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc62E9PVD1 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc62E9PVD1 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc62E9PVD1 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc62E9PVD1 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc62E9PVD1 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc62E9PVD1 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc62E9PVD1 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc62E9PVD1 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc62E9PVD1 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc62E9PVD1 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc62E9PVD1 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc62E9PVD1 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc62E9PVD1 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc62E9PVD1 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc62E9PVD1 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc62E9PVD1 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc62E9PVD1 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc62E9PVD1 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc62E9PVD1 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc62E9PVD1 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc62E9PVD1 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc62E9PVD1 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc62E9PVD1 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc62E9PVD1 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc62E9PVD1 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc62E9PVD1 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc62E9PVD1 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc62E9PVD1 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc62E9PVD1 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc62E9PVD1 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc62E9PVD1 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc62E9PVD1 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc62E9PVD1 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc62E9PVD1 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc62E9PVD1 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc62E9PVD1 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc62E9PVD1 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc62E9PVD1 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms