Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC19■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Syde2E9PUP1 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms