Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6W3

Rdh8, Retinol dehydrogenase 8, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh8D3Z6W3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Rdh8D3Z6W3 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Rdh8D3Z6W3 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rdh8D3Z6W3 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rdh8D3Z6W3 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rdh8D3Z6W3 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rdh8D3Z6W3 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Rdh8D3Z6W3 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rdh8D3Z6W3 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rdh8D3Z6W3 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rdh8D3Z6W3 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rdh8D3Z6W3 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rdh8D3Z6W3 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rdh8D3Z6W3 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rdh8D3Z6W3 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rdh8D3Z6W3 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rdh8D3Z6W3 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Rdh8D3Z6W3 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rdh8D3Z6W3 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rdh8D3Z6W3 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rdh8D3Z6W3 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rdh8D3Z6W3 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rdh8D3Z6W3 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rdh8D3Z6W3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rdh8D3Z6W3 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rdh8D3Z6W3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rdh8D3Z6W3 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rdh8D3Z6W3 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Rdh8D3Z6W3 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rdh8D3Z6W3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Rdh8D3Z6W3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rdh8D3Z6W3 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rdh8D3Z6W3 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rdh8D3Z6W3 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rdh8D3Z6W3 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rdh8D3Z6W3 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rdh8D3Z6W3 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rdh8D3Z6W3 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rdh8D3Z6W3 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rdh8D3Z6W3 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rdh8D3Z6W3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rdh8D3Z6W3 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rdh8D3Z6W3 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rdh8D3Z6W3 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rdh8D3Z6W3 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Rdh8D3Z6W3 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Rdh8D3Z6W3 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rdh8D3Z6W3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rdh8D3Z6W3 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rdh8D3Z6W3 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Rdh8D3Z6W3 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rdh8D3Z6W3 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rdh8D3Z6W3 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rdh8D3Z6W3 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rdh8D3Z6W3 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rdh8D3Z6W3 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rdh8D3Z6W3 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rdh8D3Z6W3 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rdh8D3Z6W3 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rdh8D3Z6W3 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rdh8D3Z6W3 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rdh8D3Z6W3 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rdh8D3Z6W3 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rdh8D3Z6W3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rdh8D3Z6W3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rdh8D3Z6W3 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rdh8D3Z6W3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rdh8D3Z6W3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Rdh8D3Z6W3 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rdh8D3Z6W3 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rdh8D3Z6W3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rdh8D3Z6W3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rdh8D3Z6W3 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rdh8D3Z6W3 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rdh8D3Z6W3 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rdh8D3Z6W3 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rdh8D3Z6W3 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rdh8D3Z6W3 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rdh8D3Z6W3 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rdh8D3Z6W3 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rdh8D3Z6W3 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rdh8D3Z6W3 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rdh8D3Z6W3 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rdh8D3Z6W3 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rdh8D3Z6W3 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rdh8D3Z6W3 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rdh8D3Z6W3 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rdh8D3Z6W3 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rdh8D3Z6W3 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rdh8D3Z6W3 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rdh8D3Z6W3 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rdh8D3Z6W3 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rdh8D3Z6W3 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rdh8D3Z6W3 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rdh8D3Z6W3 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rdh8D3Z6W3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rdh8D3Z6W3 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rdh8D3Z6W3 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rdh8D3Z6W3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rdh8D3Z6W3 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms