Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc6D3YZP9 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
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Ccdc6D3YZP9 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
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Ccdc6D3YZP9 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
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Ccdc6D3YZP9 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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Ccdc6D3YZP9 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc6D3YZP9 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
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