Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms