Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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