Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Brpf1B2RRD7 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms