Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS2

Gm11127, MHC classIb T15, mousemouse

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11127A7VMS2 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm11127A7VMS2 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm11127A7VMS2 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm11127A7VMS2 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm11127A7VMS2 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm11127A7VMS2 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm11127A7VMS2 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm11127A7VMS2 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm11127A7VMS2 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm11127A7VMS2 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm11127A7VMS2 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm11127A7VMS2 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm11127A7VMS2 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm11127A7VMS2 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm11127A7VMS2 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm11127A7VMS2 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm11127A7VMS2 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm11127A7VMS2 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm11127A7VMS2 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm11127A7VMS2 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm11127A7VMS2 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm11127A7VMS2 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm11127A7VMS2 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm11127A7VMS2 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm11127A7VMS2 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm11127A7VMS2 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm11127A7VMS2 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm11127A7VMS2 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm11127A7VMS2 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm11127A7VMS2 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm11127A7VMS2 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm11127A7VMS2 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm11127A7VMS2 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm11127A7VMS2 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm11127A7VMS2 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm11127A7VMS2 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm11127A7VMS2 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm11127A7VMS2 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm11127A7VMS2 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm11127A7VMS2 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm11127A7VMS2 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm11127A7VMS2 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm11127A7VMS2 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm11127A7VMS2 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm11127A7VMS2 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm11127A7VMS2 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm11127A7VMS2 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm11127A7VMS2 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm11127A7VMS2 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm11127A7VMS2 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm11127A7VMS2 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm11127A7VMS2 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm11127A7VMS2 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm11127A7VMS2 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm11127A7VMS2 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm11127A7VMS2 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm11127A7VMS2 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm11127A7VMS2 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm11127A7VMS2 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm11127A7VMS2 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm11127A7VMS2 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm11127A7VMS2 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm11127A7VMS2 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Gm11127A7VMS2 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm11127A7VMS2 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm11127A7VMS2 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm11127A7VMS2 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm11127A7VMS2 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm11127A7VMS2 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm11127A7VMS2 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm11127A7VMS2 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm11127A7VMS2 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm11127A7VMS2 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm11127A7VMS2 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm11127A7VMS2 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm11127A7VMS2 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm11127A7VMS2 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm11127A7VMS2 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm11127A7VMS2 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm11127A7VMS2 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm11127A7VMS2 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm11127A7VMS2 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm11127A7VMS2 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm11127A7VMS2 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm11127A7VMS2 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm11127A7VMS2 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm11127A7VMS2 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm11127A7VMS2 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm11127A7VMS2 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm11127A7VMS2 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm11127A7VMS2 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm11127A7VMS2 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm11127A7VMS2 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm11127A7VMS2 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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